花卉苗木基地申请减免增值税和所得税

对于你描述的情况确实有税收优惠政策。具体是：
增值税
《中华人民共和国增值税暂行条例》规定农业生产者销售的自产农产品免征增值税；
所得税
《中华人民共和国企业所得税法》及其实施条例规定花卉种植可以减半征收企业所得税，即按法定税率25%减半征收，执行12.5%的实际征收税率。
上述两个税种的优惠政策都强调的是公司直接从事花卉的种植、培育才可以享受优惠。
具体执行起来各地税务机关可能有不同规定，可以咨询主管国税部门具体措施。

又种植又销售是怎么回事？
种植+销售，应缴纳增值税，在国税部门办理；

如果租给别人摊位，我们只管理这个基地又是怎么回事啊？
如上所说，享受优惠的必须是直接从事该类工作。如果租赁经营，则你要缴纳营业税和企业所得税，均无税收优惠。

对你补充问题的回答：
增值税政策中的“农业生产者”并未单指农民个人，因此除自然人以外，机构直接从事种植，并销售自产农产品，是可以享受免征增值税政策的。

增值税和企业所得税都要交。
增值税对销售额计征，企业所得税对所得额（简单说就是利润）计征。两个不同的税种。